Protein–RNA interactions for Protein: O14737

PDCD5, Programmed cell death protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD5O14737 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD5O14737 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD5O14737 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD5O14737 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD5O14737 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms