Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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