Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms