Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms