Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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