Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms