Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L4A6NCW7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L4A6NCW7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms