Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms