Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms