Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms