Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2J1Q9Y385 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms