Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR3KQ9Y2Y1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR3KQ9Y2Y1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms