Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms