Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3Q9UPQ7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms