Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms