Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms