Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCC3Q9ULS5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMCC3Q9ULS5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms