Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms