Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms