Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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