Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms