Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms