Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms