Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms