Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms