Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms