Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms