Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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