Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD3Q9P035 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms