Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIS18AQ9NYP9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms