Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms