Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms