Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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