Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms