Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms