Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms