Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms