Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FBXO8Q9NRD0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms