Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms