Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A8Q9C0K1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC39A8Q9C0K1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A8Q9C0K1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A8Q9C0K1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A8Q9C0K1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A8Q9C0K1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A8Q9C0K1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A8Q9C0K1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A8Q9C0K1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A8Q9C0K1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A8Q9C0K1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms