Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms