Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM55Q9BYV6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms