Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms