Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms