Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC11Q9BVV2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms