Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms