Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREX2Q9BQ50 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms