Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms