Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms