Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms